SHAPPEing agent-based models to spatial data: Sequential Hooke's law Algorithm for Point Pattern reconstruction with Environmental constraints
预印本（未经同行评审）：Mongeon 与 Craig（蒙特利尔大学）提出 SHAPPE，一种多类型点模式重建算法，可从小块成像区域生成任意尺寸的合成空间布局，用于初始化基于主体的模型（ABM）。在 87 个胶质母细胞瘤成像质谱流式（IMC）样本上，作者报告 SHAPPE 相比随机基线使密度分布差异中位数降低 53%、细胞类型间暴露误差降低 34%。用 SHAPPE 代替随机布点初始化胶质母细胞瘤 ABM 后，肿瘤–CD8+ T 细胞相互作用频率下降，50 天模拟中 CD8+ T 细胞平均杀伤的肿瘤细胞数减少逾 20%。
- 作者 / 机构
- Mongeon B, Craig M.
- 发表于
- bioRxiv (preprint, not peer-reviewed)
- 日期
- 2026-10-16
- 类型
- 预印本
- 年份
- 2026
- DOI
- 10.64898/2026.10.14.759208
- 核验来源
- bioRxiv API details (title, 2 authors, posted 2026-10-16, v1, new results, systems biology, CC BY-NC, Université de Montréal, abstract) fetched 2026-10-20; full text not read
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