Point-Process Modelling of Cell-Type Interaction Structure in CosMx Glioma Data for Hypothesis-Driven Tumor Inference from scRNA-seq
预印本(未经同行评审):Carcanholo 等(圣保罗大学里贝朗普雷图医学院)用全组织对数高斯 Cox 过程模型分析 8 例 GBM 样本的 CosMx 数据(2,427,362 个细胞、15 类细胞群、4 种恶性状态);免疫细胞群在空间上趋近恶性状态细胞;转录特征可预测细胞级空间表型,但留一患者验证使性能下降,按患者校正也未能恢复跨患者可迁移性。样本量小(8 例);作者指出需要更大、更多样的空间队列。
- 作者 / 机构
- Carcanholo FP, Cassiano MHA, Panepucci EM, Laurini MP, Malta TM.
- 发表于
- bioRxiv (preprint, not peer-reviewed)
- 日期
- 2026-10-10
- 类型
- 预印本
- 年份
- 2026
- DOI
- 10.64898/2026.10.02.756019
- 核验来源
- bioRxiv API details (title, 5 authors, posted 2026-10-10, v1, new results, CC BY-NC, corresponding institution Ribeirão Preto Medical School - USP, abstract) + Crossref posted-content record fetched 2026-10-20; full text not read
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涉及的实体
- 胶质母细胞瘤 疾病
- 单细胞 RNA 测序 方法与概念