论文✓ 已核验VC0173
Ma N, Wang Z, Yang X, Yang G, Yang R, Wang Z, Jiang Q, Chu Y. · Briefings in Bioinformatics · 2026-10-18
综述（Ma 等；资深作者 Jiang Q 与 Chu Y；Briefings in Bioinformatics 2026）：以“状态编码—状态转移—观测解码”作为统一抽象，梳理机理模型、数据驱动的基础模型与扰动模型、多模态系统及空间/多尺度模拟，并讨论模型边界、数据基础、资源公开、分布外评测、因果证据与实验验证。作者指出，独立基准显示参数量和训练集规模并不会自动带来稳健的分布外泛化。
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论文✓ 已核验VC0175
Ni J, Zhang X, Li M, Cai Y, Xie Z, Liu Y. · Computational Biology and Chemistry · 2026-10-09
Ni 等（东南大学；Computational Biology and Chemistry 2026）在同一图注意力骨架中，将 STRING/基因本体（GO）图先验与稠密、仅自环和保度重连的支撑结构对比，使用 4 个公开 Perturb-seq 数据集（Adamson、Norman、Replogle K562 与 RPE1），并在相同留出 guide 条件下评测 GEARS、scGPT 与 Geneformer。在 200 个高变基因下，STRING-GO 比稠密支撑的 Pearson r 高 +0.016（95% 区间 +0.010 至 +0.022），1000 个基因时降至 +0.009。与外部模型的 36 组匹配对比中，32 组落在 ±0.030 区间内，其余 4 组均是外部模型更优。作者说明主要对比是在审稿修改阶段提出的，且这一小幅提升本身不能说明生物学意义。
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论文脑肿瘤✓ 已核验VC0171
Pitarch-Abaigar C, Lohmann P, Aloy P, Al-Shahrour F, Arnaout O, Bi WL, Galldiks N, Huse JT, Karschnia P, Nasrallah MP, Patel A, Rahman R, Sahm F, Smith TR, Tonn JC, Umeton R, Valiente M, Zarella M, Huang RY, Bakas S. · Neuro-Oncology · 2026-10-13
RANO（神经肿瘤疗效评估）各工作组联合综述（Pitarch-Abaigar 等；通讯/资深作者 Huang RY 与 Bakas S；Neuro-Oncology 2026），覆盖 AI 在神经影像、神经病理、检验医学、神经外科、药物发现与临床试验六个领域的应用。作者认为最接近临床应用的是影像分割与定量、AI 辅助图像重建、基于 DNA 甲基化的分类和流程优化；影像基因组学、基于全切片图像的分子预测、AI 引导的手术定位、液体活检解读、AI 药物发现、数字孪生与计算机模拟试验仍需更充分的前瞻性验证。
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论文✓ 已核验VC0006
Ukaegbu D, Curean V, Bender A, Maertens A. · ALTEX · 2026-09-17
观点：虚拟细胞用于环境暴露/毒理扰动建模。
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论文脑肿瘤✓ 已核验VC0084
Ellenbogen Y, Landry AP, Yefet LS, Ajisebutu A, Gui C, Persaud P, Kaloti R, Nassiri F. · Neuro-oncology advances · 2026-02-27
综述：脑膜瘤单细胞基因组学现状。
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论文✓ 已核验VC0004
Ma C, Zhang H, Rao Y, Jiang X, Liu B, Sun Z, Song Z, Gao Y, Cui Y, Liu X, Li Z. · NPJ digital medicine · 2025-12-11
综述：AI虚拟细胞在临床前研究中的技术路径与验证机制。
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