BioMod: Biological Module Tokenization for Single-Cell Foundation Modeling
预印本(未经同行评审):Meng 等(深圳河套学院)提出 BioMod,一个 5000 万参数的单细胞基础模型,以 660 个相互重叠的生物模块(来自策展通路与数据驱动的基因程序)代替单个基因来表示细胞,在约 7300 万个人类细胞上预训练。作者报告其在细胞类型注释、零样本批次整合、扰动响应预测与药物响应预测上达到当前最佳,且可在单块 GPU 上推理。为作者自报结果,尚无独立评测。
- 作者 / 机构
- Meng L, Zhu J, Han B, Zang Y, Li W, Zong K, Zhong J, Yang Y, Liu J, Jia J, Sun R, Yu G, Han J, Chen Y, Zhang L, Xu J.
- 发表于
- bioRxiv (preprint, not peer-reviewed)
- 日期
- 2026-10-13
- 类型
- 预印本
- 年份
- 2026
- DOI
- 10.64898/2026.10.12.758490
- 核验来源
- bioRxiv API details (title, 16 authors, posted 2026-10-13, v1, new results, bioinformatics, CC BY, corresponding institution Shenzhen Loop Area Institute, abstract) fetched 2026-10-20; full text not read
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涉及的实体
- 单细胞基础模型 方法与概念
- 单细胞 RNA 测序 方法与概念
- 零样本评估 方法与概念