Simple controls exceed best deep learning algorithms and reveal foundation model effectiveness for predicting genetic perturbations.
Wong、Hill、Moccia(Bioinformatics 2025):报告“CRISPR 先验均值”(训练集扰动细胞均值,靶基因按 CRISPRi/CRISPRa 先验设定)在 Adamson、Norman、Replogle K562 Essential 上优于微调 scGPT、GEARS 及简单神经基线;并提供修正后的 Adamson 数据集。
- 作者 / 机构
- Wong DR, Hill AS, Moccia R.
- 发表于
- Bioinformatics
- 日期
- 2025-06-01
- 类型
- 论文
- 年份
- 2025
- DOI
- 10.1093/bioinformatics/btaf317
- PMID
- 40407144
- 核验来源
- Europe PMC (metadata, abstract) + Europe PMC full-text XML read 2026-10-16 (PMC12202205)