Generating high-quality Perturb-seq data for the 2026 Virtual Cell Challenge
Arc 对 2026 挑战赛数据生成方式的说明(机构自述,非独立评估):在 6 个人源细胞系中进行 CRISPRi Perturb-seq,采用 10x Flex 检测;每个细胞系分析 >10,000 个扰动及 100 条非靶向 sgRNA,筛选中位靶基因表达下降 ≥80% 的扰动并下采样至每个扰动 400 个细胞;任务为零样本(仅提供未扰动细胞);未报告任何模型结果。
- 作者 / 机构
- Arc Institute
- 发表于
- Arc news
- 日期
- 2026-10-01
- 类型
- 新闻
- 年份
- 2026
- 原文
- https://arcinstitute.org/news/behind-the-data-virtual-cell-challenge-2026
- 核验来源
- Arc Institute news page (publisher; fetched 2026-10-16: title, date 2026-10-01, six cell lines, CRISPRi, 10x Flex, 400 cells/perturbation, >=80% median knockdown, NTC and cell counts)
被 GlioState 专题引用
涉及的实体
- CRISPR 干扰 方法与概念
- Perturb-seq 方法与概念
- 虚拟细胞挑战赛 方法与概念
- 零样本评估 方法与概念